—、光學顯微鏡
(一)、普通光學顯微鏡
普通生物顯微鏡由3部分構(gòu)成，即：①照明系統(tǒng)，包括光源和聚光器;②光學放大系統(tǒng)，由物鏡和目鏡組成，是顯微鏡的主體，為了消除球差和色差，目鏡和物鏡都由復雜的透鏡組構(gòu)成;③機械裝置，用于固定材料和觀察方便
顯微鏡物象是否清楚不僅決定于放大倍數(shù)，還與顯微鏡的分辨力(resolution)有關，分辨力是指顯微鏡(或人的眼睛距目標25cm處)能分辨物體最小間隔的能力，分辨力的大小決定于光的波長和鏡口率以及介質(zhì)的折射率，用公式表示為：
R=0.61λ /N.A. N.A.=nsinα/2
式中：n=介質(zhì)折射率;α=鏡口角(標本對物鏡鏡口的張角)，N.A.=鏡口率(numeric aperture)。鏡口角總是要小于180?，所以sina/2的最大值必然小于1。
制作光學鏡頭所用的玻璃折射率為1.65~1.78，所用介質(zhì)的折射率越接近玻璃的越好。對于干燥物鏡來說，介質(zhì)為空氣，鏡口率一般為0.05~0.95;油鏡頭用香柏油為介質(zhì)，鏡口率可接近1.5。
普通光線的波長為400~700nm，因此顯微鏡分辨力數(shù)值不會小于0.2μm，人眼的分辨力是0.2mm，所以一般顯微鏡設計的最大放大倍數(shù)通常為1000X。
(二)、熒光顯微鏡
細胞中有些物質(zhì)，如葉綠素等，受紫外線照射后可發(fā)熒光;另有一些物質(zhì)本身雖不能發(fā)熒光，但如果用熒光染料或熒光抗體染色后，經(jīng)紫外線照射亦可發(fā)熒光，熒光顯微鏡就是對這類物質(zhì)進行定性和定量研究的工具之一。
熒光顯微鏡和普通顯微鏡有以下的區(qū)別：
1. 照明方式通常為落射式，即光源通過物鏡投射于樣品上
2. 光源為紫外光，波長較短，分辨力高于普通顯微鏡;
3. 有兩個特殊的濾光片，光源前的用以濾除可見光，目鏡和物鏡之間的用于濾除紫外線，用以保護人目。
(三)、激光共聚焦掃描顯微境
激光共聚焦掃描顯微鏡(laser confocal scanning microscope，)用激光作掃描光源，逐點、逐行、逐面快速掃描成像，掃描的激光與熒光收集共用一個物鏡，物鏡的焦點即掃描激光的聚焦點，也是瞬時成像的物點。由于激光束的波長較短，光束很細，所以共焦激光掃描顯微鏡有較高的分辨力，大約是普通光學顯微鏡的3倍。系統(tǒng)經(jīng)一次調(diào)焦，掃描限制在樣品的一個平面內(nèi)。調(diào)焦深度不一樣時，就可以獲得樣品不同深度層次的圖像，這些圖像信息都儲于計算機內(nèi)，通過計算機分析和模擬，就能顯示細胞樣品的立體結(jié)構(gòu)。
激光共聚焦掃描顯微鏡既可以用于觀察細胞形態(tài)，也可以用于細胞內(nèi)生化成分的定量分析、光密度統(tǒng)計以及細胞形態(tài)的測量。
(四)、暗視野顯微鏡
暗視野顯微鏡(dark field microscope，)的聚光鏡中央有當光片，使照明光線不直接進人物鏡，只允許被標本反射和衍射的光線進入物鏡，因而視野的背景是黑的，物體的邊緣是亮的。利用這種顯微鏡能見到小至 4~200nm的微粒子，分辨率可比普通顯微鏡高50倍。
(五)、相差顯微鏡
相差顯微鏡(phasecontrast microscope，)由P.Zernike于1932年發(fā)明，并因此獲1953年諾貝爾物理獎。這種顯微鏡最大的特點是可以觀察未經(jīng)染色的標本和活細胞。
相差顯微鏡的基本原理是，把透過標本的可見光的光程差變成振幅差，從而提高了各種結(jié)構(gòu)間的對比度，使各種結(jié)構(gòu)變得清晰可見。光線透過標本后發(fā)生折射，偏離了原來的光路，同時被延遲了1/4λ(波長)，如果再增加或減少1/4λ，則光程差變?yōu)?/2λ，兩束光合軸后干涉加強，振幅增大或減下，提高反差。在構(gòu)造上，相差顯微鏡有不同于普通光學顯微鏡兩個特殊之處：
1. 環(huán)形光闌(annular diaphragm) 位于光源與聚光器之間，作用是使透過聚光器的光線形成空心光錐，焦聚到標本上。
2. 相位板(annular phaseplate)在物鏡中加了涂有氟化鎂的相位板，可將直射光或衍射光的相位推遲1/4λ。分為兩種：
1. A+相板：將直射光推遲1/4λ，兩組光波合軸后光波相加，振幅加大，標本結(jié)構(gòu)比周圍介質(zhì)更加變亮，形成亮反差(或稱負反差)。
2. B+相板：將衍射光推遲1/4λ，兩組光線合軸后光波相減，振幅變小，形成暗反差(或稱正反差)，結(jié)構(gòu)比周圍介質(zhì)更加變暗。
(六)、偏光顯微鏡
偏光顯微鏡(polarizing microscope)用于檢測具有雙折射性的物質(zhì)，如纖維絲、紡錘體、膠原、染色體等等。和普通顯微鏡不同的是：其光源前有偏振片(起偏器)，使進入顯微鏡的光線為偏振光，鏡筒中有檢偏器(一個偏振方向與起偏器垂直的的起偏器)，這種顯微鏡的載物臺是可以旋轉(zhuǎn)的，當載物臺上放入單折射的物質(zhì)時，無論如何旋轉(zhuǎn)載物臺，由于兩個偏振片是垂直的，顯微鏡里看不到光線，而放入雙折射性物質(zhì)時，由于光線通過這類物質(zhì)時發(fā)生偏轉(zhuǎn)，因此旋轉(zhuǎn)載物臺便能檢測到這種物體。
(七)、微分干涉差顯微鏡
1952年，Nomarski在相差顯微鏡原理的基礎上發(fā)明了微分干涉差顯微鏡(differential interference contrast microscope)。DIC顯微鏡又稱Nomarski相差顯微鏡(Nomarki contrast microscope)，其優(yōu)點是能顯示結(jié)構(gòu)的三維立體投影影像。與相差顯微鏡相比，其標本可略厚一點，折射率差別更大，故影像的立體感更強。
DIC顯微鏡的物理原理完全不同于相差顯微鏡，技術設計要復雜得多。DIC利用的是偏振光，有四個特殊的光學組件：偏振器(polarizer)、DIC棱鏡、DIC滑行器和檢偏器(analyzer)。偏振器直接裝在聚光系統(tǒng)的前面，使光線發(fā)生線性偏振。在聚光器中則安裝了石英Wollaston棱鏡，即DIC棱鏡，此棱鏡可將一束光分解成偏振方向不同的兩束光(x和y)，二者成一小夾角。聚光器將兩束光調(diào)整成與顯微鏡光軸平行的方向。最初兩束光相位一致，在穿過標本相鄰的區(qū)域后，由于標本的厚度和折射率不同，引起了兩束光發(fā)生了光程差。在物鏡的后焦面處安裝了第二個Wollaston棱鏡，即DIC滑行器，它把兩束光波合并成一束。這時兩束光的偏振面(x和y)仍然存在。最后光束穿過第二個偏振裝置，即檢偏器。在光束形成目鏡DIC影像之前，檢偏器與偏光器的方向成直角。檢偏器將兩束垂直的光波組合成具有相同偏振面的兩束光，從而使二者發(fā)生干涉。x和y波的光程差決定著透光的多少。光程差值為0時，沒有光穿過檢偏器;光程差值等于波長一半時，穿過的光達到最大值。于是在灰色的背景上，標本結(jié)構(gòu)呈現(xiàn)出亮暗差。為了使影像的反差達到最佳狀態(tài)，可通過調(diào)節(jié)DIC滑行器的縱行微調(diào)來改變光程差，光程差可改變影像的亮度。調(diào)節(jié)DIC滑行器可使標本的細微結(jié)構(gòu)呈現(xiàn)出正或負的投影形象，通常是一側(cè)亮，而另一側(cè)暗，這便造成了標本的人為三維立體感，類似大理石上的浮雕
DIC顯微鏡使細胞的結(jié)構(gòu)，特別是一些較大的細胞器，如核、線粒體等，立體感特別強，適合于顯微操作。目前像基因注入、核移植、轉(zhuǎn)基因等的顯微操作常在這種顯微鏡下進行。
(八)、倒置顯微鏡
組成和普通顯微鏡一樣，只不過物鏡與照明系統(tǒng)顛倒，前者在載物臺之下，后者在載物臺之上(圖2-11)，用于觀察培養(yǎng)的活細胞，具有相差物鏡。
進入20世紀80年代以來，光學顯微鏡的設計和制作又有了很大的發(fā)展，其發(fā)展趨勢主要表現(xiàn)在，注重實用性和多功能方面的改進。在裝配設計上趨于采用組合方式，集普通光鏡加相差、熒光、暗視野、DIC、攝影裝置于一體，從而操作靈活，使用方便。
二、電子顯微鏡
(一)、透射電子顯微鏡
1、基本原理
在光學顯微鏡下無法看清小于0.2μm的細微結(jié)構(gòu)，這些結(jié)構(gòu)稱為亞顯微結(jié)構(gòu)(submicroscopic structures)或超微結(jié)構(gòu)(ultramicroscopic structures;ultrastructures)。要想看清這些結(jié)構(gòu)，就必須選擇波長更短的光源，以提高顯微鏡的分辨率。1932年Ruska發(fā)明了以電子束為光源的透射電子顯微鏡(transmission electron microscope，TEM)，電子束的波長要比可見光和紫外光短得多，并且電子束的波長與發(fā)射電子束的電壓平方根成反比，也就是說電壓越高波長越短。目前TEM的分辨力可達0.2nm。
電子顯微鏡與光學顯微鏡的成像原理基本一樣，所不同的是前者用電子束作光源，用電磁場作透鏡。另外，由于電子束的穿透力很弱，因此用于電鏡的標本須制成厚度約50nm左右的超薄切片。這種切片需要用超薄切片機(ultramicrotome)制作。電子顯微鏡的放大倍數(shù)最高可達近百萬倍、由電子照明系統(tǒng)、電磁透鏡成像系統(tǒng)、真空系統(tǒng)、記錄系統(tǒng)、電源系統(tǒng)等5部分構(gòu)成。
2、制樣技術
1)超薄切片
通常以鋨酸和戊二醛固定樣品，以環(huán)氧樹脂包埋，以熱膨脹或螺旋推進的方式推進樣品切片(圖2-13)，切片厚度20~50nm，切片采用重金屬鹽染色，以增大反差(圖2-14)。
2)負染技術
負染就是用重金屬鹽(如磷鎢酸、醋酸雙氧鈾)對鋪展在載網(wǎng)上的樣品進行染色;吸去染料，樣品干燥后，樣品凹陷處鋪了一薄層重金屬鹽，而凸的出地方則沒有染料沉積，從而出現(xiàn)負染效果(圖2-15)，分辨力可達1.5nm左右。
3)冰凍蝕刻
冰凍蝕刻(freeze-etching)亦稱冰凍斷裂(freeze-fracture)。標本置于-100?C的干冰或-196?C的液氮中，進行冰凍。然后用冷刀驟然將標本斷開，升溫后，冰在真空條件下迅即升華，暴露出斷面結(jié)構(gòu)，稱為蝕刻(etching)。蝕刻后，向斷面以45度角噴涂一層蒸汽鉑，再以90度角噴涂一層碳，加強反差和強度。然后用次氯酸鈉溶液消化樣品，把碳和鉑的膜剝下來，此膜即為復膜(replica)。復膜顯示出了標本蝕刻面的形態(tài)，在電鏡下得到的影像即代表標本中細胞斷裂面處的結(jié)構(gòu)(圖2-16)。
(二)、掃描電子顯微鏡
掃描電子顯微鏡(scanning electron microscope，SEM，圖2-17、18、19)于20世紀60年代問世，用來觀察標本的表面結(jié)構(gòu)。其工作原理是用一束極細的電子束掃描樣品，在樣品表面激發(fā)出次級電子，次級電子的多少與電子束入射角有關，也就是說與樣品的表面結(jié)構(gòu)有關，次級電子由探測體收集，并在那里被閃爍器轉(zhuǎn)變?yōu)楣庑盘?，再?jīng)光電倍增管和放大器轉(zhuǎn)變?yōu)殡娦盘杹砜刂茻晒馄辽想娮邮膹姸?，顯示出與電子束同步的掃描圖像。圖像為立體形象，反映了標本的表面結(jié)構(gòu)。為了使標本表面發(fā)射出次級電子，標本在固定、脫水后，要噴涂上一層重金屬微粒，重金屬在電子束的轟擊下發(fā)出次級電子信號。
目前掃描電鏡的分辨力為6~10nm，人眼能夠區(qū)別熒光屏上兩個相距0.2mm的光點，則掃描電鏡的最大有效放大倍率為0.2mm/100nm=20000X。
(三)、掃描隧道顯微鏡
掃描隧道顯微鏡(scanning tunneling microscope，STM) 由Binnig等1981年發(fā)明，根據(jù)量子力學原理中的隧道效應而設計。當原子尺度的針尖在不到一個納米的高度上掃描樣品時，此處電子云重疊，外加一電壓(2mV~2V)，針尖與樣品之間產(chǎn)生隧道效應而有電子逸出，形成隧道電流。電流強度和針尖與樣品間的距離有函數(shù)關系，當探針沿物質(zhì)表面按給定高度掃描時，因樣品表面原子凹凸不平，使探針與物質(zhì)表面間的距離不斷發(fā)生改變，從而引起電流不斷發(fā)生改變。將電流的這種改變圖像化即可顯示出原子水平的凹凸形態(tài)。掃描隧道顯微鏡的分辨率很高，橫向為0.1~0.2nm，縱向可達0.001nm。它的優(yōu)點是三態(tài)(固態(tài)、液態(tài)和氣態(tài))物質(zhì)均可進行觀察，而普通電鏡只能觀察制作好的固體標本。
利用掃描隧道顯微鏡直接觀察生物大分子，如DNA、RNA和蛋白質(zhì)等分子的原子布陣，和某些生物結(jié)構(gòu)，如生物膜、細胞壁等的原子排列。
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