2016年1月29日，科技部、 財政部、 國家稅務總局聯(lián)合發(fā)布了修訂后的《高新技術企業(yè)認定管理辦法》，在與企業(yè)相關的“認定條件與程序”、“監(jiān)督管理”的兩個方面，新管理辦法均做出了很大調整：一是放寬了高新技術企業(yè)認定的具體條件，讓更多科技企業(yè)受惠于國家政策，在科研人員比例、研發(fā)費用占比等核心條件上放寬標準；二是完善以往政策的不足，提高政策彈性，更加符合實際；三是明顯強化后續(xù)監(jiān)督力度，提高對企業(yè)合規(guī)性的要求，違規(guī)成本增大。
為了幫助大家更好的了解新的政策，對比如下：
一、認定條件方面
二、認定的程序性和監(jiān)督管理方面事項
對于2016年32號文件中高新技術企業(yè)認定的程序性和監(jiān)督管理事項，應關注以下幾點：
1、申請高新技術認定的企業(yè)，提交的申請資料中新增“近一個會計年度高新技術產(chǎn)品（服務）收入專項審計或鑒證報告”以及“近三個會計年度企業(yè)所得稅年度納稅申報表”；
2、審查認定的公示時間由15個工作日減少至10個工作日，提高行政效率；
3、進一步明確稅收優(yōu)惠享受的起始和終止時間：
（1）起始時間：企業(yè)獲得高新技術企業(yè)資格后，自高新技術企業(yè)證書頒發(fā)之日所在年度起享受稅收優(yōu)惠；
（2）終止時間：
①對已認定的高新技術企業(yè)，經(jīng)復核被認定為不符合高新技術企業(yè)條件而被取消高新技術企業(yè)資格的，稅務機關將追繳其不符合認定條件年度起已享受的稅收優(yōu)惠；
②對于已認定的高新技術企業(yè)，因故而被取消高新技術企業(yè)資格的，稅務機關可追繳其自發(fā)生相關行為之日所屬年度起已享受的高新技術企業(yè)稅收優(yōu)惠。
4、明確高新技術企業(yè)的自主申報事項：
（1）企業(yè)獲得高新技術企業(yè)資格后，應于每年5月底前在“高新技術企業(yè)認定管理工作網(wǎng)”填報上一年度知識產(chǎn)權、科技人員、研發(fā)費用、經(jīng)營收入等年度發(fā)展情況報表；
（2）高新技術企業(yè)發(fā)生更名或與認定條件有關的重大變化（如分立、合并、重組以及經(jīng)營業(yè)務發(fā)生變化等）應在三個月內向認定機構報告。2008年172號文件曾規(guī)定發(fā)生上述情況時，需于15日內向認定機構報告，2016年32號文件報告時限放寬，更有利于納稅人。
新增“未按期報告與認定條件有關重大變化情況，或累計兩年未填報年度發(fā)展情況報表的，將被取消高新資格。”
5、高新技術企業(yè)跨認定機構管理區(qū)域搬遷時，高新技術企業(yè)資格的延續(xù)問題：
（1）企業(yè)于高新技術企業(yè)資格有效期內完成整體遷移的，資格繼續(xù)有效；
（2）企業(yè)部分搬遷的，由遷入地認定機構重新認定；
6、應注意企業(yè)存在偷、騙稅行為的，不再作為取消高新技術資格的情形之一。
7、新增了監(jiān)督檢查方式，即科技部、財政部、稅務總局建立隨機抽查和重點檢查機制，加強對各地高新技術企業(yè)認定管理工作的監(jiān)督檢查。
8、2016年32號文件取消了高新技術企業(yè)復審的規(guī)定。意味著到期以后，企業(yè)應該重新申請認定認定。
為了幫助大家更好的了解新的政策，對比如下：
一、認定條件方面
二、認定的程序性和監(jiān)督管理方面事項
對于2016年32號文件中高新技術企業(yè)認定的程序性和監(jiān)督管理事項，應關注以下幾點：
1、申請高新技術認定的企業(yè)，提交的申請資料中新增“近一個會計年度高新技術產(chǎn)品（服務）收入專項審計或鑒證報告”以及“近三個會計年度企業(yè)所得稅年度納稅申報表”；
2、審查認定的公示時間由15個工作日減少至10個工作日，提高行政效率；
3、進一步明確稅收優(yōu)惠享受的起始和終止時間：
（1）起始時間：企業(yè)獲得高新技術企業(yè)資格后，自高新技術企業(yè)證書頒發(fā)之日所在年度起享受稅收優(yōu)惠；
（2）終止時間：
①對已認定的高新技術企業(yè)，經(jīng)復核被認定為不符合高新技術企業(yè)條件而被取消高新技術企業(yè)資格的，稅務機關將追繳其不符合認定條件年度起已享受的稅收優(yōu)惠；
②對于已認定的高新技術企業(yè)，因故而被取消高新技術企業(yè)資格的，稅務機關可追繳其自發(fā)生相關行為之日所屬年度起已享受的高新技術企業(yè)稅收優(yōu)惠。
4、明確高新技術企業(yè)的自主申報事項：
（1）企業(yè)獲得高新技術企業(yè)資格后，應于每年5月底前在“高新技術企業(yè)認定管理工作網(wǎng)”填報上一年度知識產(chǎn)權、科技人員、研發(fā)費用、經(jīng)營收入等年度發(fā)展情況報表；
（2）高新技術企業(yè)發(fā)生更名或與認定條件有關的重大變化（如分立、合并、重組以及經(jīng)營業(yè)務發(fā)生變化等）應在三個月內向認定機構報告。2008年172號文件曾規(guī)定發(fā)生上述情況時，需于15日內向認定機構報告，2016年32號文件報告時限放寬，更有利于納稅人。
新增“未按期報告與認定條件有關重大變化情況，或累計兩年未填報年度發(fā)展情況報表的，將被取消高新資格。”
5、高新技術企業(yè)跨認定機構管理區(qū)域搬遷時，高新技術企業(yè)資格的延續(xù)問題：
（1）企業(yè)于高新技術企業(yè)資格有效期內完成整體遷移的，資格繼續(xù)有效；
（2）企業(yè)部分搬遷的，由遷入地認定機構重新認定；
6、應注意企業(yè)存在偷、騙稅行為的，不再作為取消高新技術資格的情形之一。
7、新增了監(jiān)督檢查方式，即科技部、財政部、稅務總局建立隨機抽查和重點檢查機制，加強對各地高新技術企業(yè)認定管理工作的監(jiān)督檢查。
8、2016年32號文件取消了高新技術企業(yè)復審的規(guī)定。意味著到期以后，企業(yè)應該重新申請認定認定。
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